In un futuro non troppo lontano, devastato dalle cicatrici della Terza Guerra Mondiale, "Appleseed Alpha" dipinge le peripezie di Deunan Knute, una tenace sopravvissuta, e del suo compagno cyborg Briareos. La loro vita da mercenari li porta a vagare tra le rovine di una New York del 22° secolo, trasformata in un desolante campo di battaglia dove la legge del più forte è l'unica a regnare.
La coppia si guadagna da vivere offrendo le proprie abilità al miglior offerente e, presto, si ritrovano invischiati nelle losche trame di un gruppo criminale. La missione: contrastare un'armata di robot implacabili che infestano la metropoli in rovina, un'impresa che metterà a dura prova le loro capacità e il loro legame.
Nell'ombra dei grattacieli inerti, Deunan e Briareos incrociano il cammino di Iris e Olson, due figure enigmatiche con un'agenda propria. La loro apparizione non è un caso: i destini dei quattro si intrecciano misteriosamente, guidandoli verso un obiettivo comune, la leggendaria città di Olympus, un faro di speranza per l'umanità nel mezzo del caos.
"Appleseed Alpha" è un viaggio attraverso le rovine di ciò che fu, un racconto di sopravvivenza e scoperta, che esplora gli albori delle avventure di Deunan e Briareos. Tra azione mozzafiato e intrighi nascosti, il film ci invita a scoprire gli antefatti dei due protagonisti e a sognare insieme a loro un domani più luminoso, in un mondo sull'orlo dell'estinzione. Un'avventura animata che cattura l'immaginazione e sfida i confini della speranza e del coraggio.