Nella tranquilla quotidianità di una famiglia di Seattle, il destino bussa alla porta sotto le inaspettate sembianze di un adolescente smarrito. Kyle, come viene chiamato, si ritrova senza memoria e senza passato, ma con una serie di strabilianti talenti che vanno ben oltre l'ordinario. Accolto con generosità dai Trager, il ragazzo dovrà imparare tutto da capo, dalle emozioni più semplici ai gesti più istintivi.
Mentre si destreggia tra i primi passi nell'universo delle emozioni umane, scoprendo la rabbia, la gioia e l'amore, ciò che distingue Kyle dagli altri emerge con prepotenza: i suoi poteri psichici non sono semplice frutto del caso, ma il risultato di un oscuro esperimento di clonazione umana. La sua esistenza, così preziosa quanto pericolosa, attira l'attenzione di forze sinistre, determinate a sfruttare le sue capacità per scopi inquietanti.
Tra il calore di una famiglia che lotta per proteggerlo e i pericoli che si annidano nell'ombra, Kyle si trova al centro di un intrigante mistero. Il ragazzo riuscirà a sfuggire a chi lo vuole reclamare come un prodotto perso e a trovare il vero significato di ciò che significa essere umani? La risposta si snoda lungo un viaggio emozionante e ricco di suspense, nel quale i confini della scienza si intrecciano con i legami dell'affetto, rendendo "Kyle XY" un'avventura che si tingerà di umanità tanto quanto di mistero.