Nel quieto tessuto urbano di Musashino City, un inquietante mistero scuote la routine della metropoli: Shounen Bat, un ragazzino in pattini a rotelle brandendo una mazza da baseball dorata, compie una serie di inspiegabili aggressioni che lasciano la comunità nell'incredulità e nel terrore. Le vittime, inizialmente non prese sul serio, si moltiplicano in una spirale di violenza che coinvolge adulti e bambini. I due detective incaricati del caso, Keiichi Ikari e Mitsuhiro Maniwa, si imbarcano in una disperata ricerca per catturare l'assalitore e svelare l'enigma dietro agli attacchi di Shounen Bat.
Ma c'è qualcosa di ancora più bizzarro che oscura la realtà: dopo essere stati colpiti, paradossalmente, le vite delle vittime sembrano prendere una svolta positiva. Mentre i detective cercano di connettere gli inspiegabili eventi, si imbattono in una serie di indizi criptici e testimonianze che si intrecciano in una tela di paranoia e mistero. Che razza di verità si cela dietro le azioni di questo strano aggressore e quali segreti rivelano questi incidenti sulla natura umana? "Paranoia Agent" è una serie che sfida le convenzioni del genere, creando un thriller psicologico che cattura e scompiglia la mente dello spettatore, incitandolo a indagare oltre le apparenze di una Tokyo ombrosa e imprevedibile.